Kamus Nomenklatur Zoologi dan Botani dibagi menjadi dua bagian monemklatur, yakni Zoologi dan Botani. Masing-masing bagian dipilah menjadi dua subbagian. Subbagian Zoologi dalam bahasa latin-Indonesia dan subbagian Zoologi dalam bahasa Indonesia-latin. serta subbagian Botani dalam bahasa Latin-Indonesia dan subbagian Botani dalam bahasa Indonesia-Latin.